符合青海省基本醫(yī)療保險藥品目錄和青海省新農合診療項目目錄的門診、住院醫(yī)藥費用納入新農合報銷范圍。下列醫(yī)藥費用不納入新農合報銷范圍：
（一） 應當從工傷保險基金中支付的；
（二） 應當由第三人負擔的；
（三）應當由公共衛(wèi)生承擔的；
（四）境外就醫(yī)的。
醫(yī)藥費用依法應當由第三人負擔的，第三人不支付或者無法確定第三人的，由新農合基金先行支付。新農合基金支付后，有權向第三人追償。
農牧區(qū)各類意外傷害，如山體滑坡、火災、雪災、水災等不可抗拒的自然災害當中受傷人員的醫(yī)藥費用納入報銷范圍，如另有報銷規(guī)定的按有關規(guī)定執(zhí)行。有責任方的意外傷害醫(yī)藥費用由責任方承擔，不納入報銷范圍。
農牧民參加新農合后居住地發(fā)生變化的，醫(yī)藥費用在參合地報銷。參合農牧民轉為城鎮(zhèn)戶籍后參加城鎮(zhèn)居民醫(yī)保的，享受當年新農合待遇直到保障年度期滿。
在治療期間補償標準發(fā)生調整的，門診費用的報銷按照發(fā)生費用時的標準執(zhí)行，住院費用的報銷按照出院時的標準執(zhí)行。
救助對象等享受特殊報銷的參合農牧民，按照發(fā)生費用時的身份屬性執(zhí)行相應的報銷標準。
住院醫(yī)藥費用報銷計算方法。
（一）每例住院患者醫(yī)藥總費用中首先剔除自費藥品和自費診療項目費用，再減去起付費用，即為報銷基數(shù)，報銷基數(shù)再乘以相應定點醫(yī)療機構報銷比例，即為新農合實際報銷額。
（二）21類重特大疾病住院醫(yī)藥費用，經首次常規(guī)報銷后，剩余醫(yī)藥費用（含住院起付費用和自費費用）從重特大疾病醫(yī)療保障基金中給予二次補助，常規(guī)首次報銷和二次補助合計，即為新農合實際報銷額。
（三）21類重特大疾病以外的其他大病住院醫(yī)藥費用經首次常規(guī)報銷后，剩余醫(yī)藥費用（不含住院起付費用和自費費用）仍在3000元以上的，從重特大疾病醫(yī)療保障基金中給予二次補助，常規(guī)首次報銷和二次補助合計，即為新農合實際報銷額。